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Immunité innée et contre-mesures virales : études biophysiques et structurales du complexe HIV-1 Vif/hAPOBEC3


Contact : Eric Ennifar

APOBEC3 est une cytidine désaminase qui inhibe la réplication de rétrovirus ou de rétrotransposons. Pour contrer l’action d’APOBEC3 et restaurer l’infectivité virale, HIV-1 exprime la protéine Vif (Virion Infectivity Factor), qui recrute un complexe E3-ubiquitine ligase cellulaire, interagit avec APOBEC3 et promeut sa dégradation par le protéasome.

Notre objectif est de résoudre la structure cristallographique du complexe APOBEC3/Vif. Parallèlement, les interactions entre les deux partenaires et leurs ligands (ARN viral ou ADN proviral) seront caractérisées d’un point de vue thermodynamique par microcalorimétrie ITC. L’ensemble de ces informations – structurales et thermodynamiques - permettra de mieux comprendre les bases moléculaires de cette interaction et ces résultats pourront servir de base pour l’élaboration de molécules capables de contrer la dégradation d’APOBEC3 par le virus.

Publications représentatives :

Freisz S, Mezher J, Hafirassou L, Wolff P, Nominé Y, Romier C, Dumas P & Ennifar E (2012). Sequence and structure requirements for specific recognition of HIV-1 TAR and DIS RNA by the HIV-1 Vif protein. RNA Biology, 9(7):966-77.