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Séquencer

par lioudmila - publié le

Séquenceur permettant le séquençage d’ADN sur 16 capillaires d’électrophorèse en parallèle.
Avant la préparation des échantillons, contacter Anne-Catherine HELFER-LE FOLL afin de programmer un run.

  • Equipement : ABI 3130xI Genetic Analyser (ThermoFischer Scientific)
  • Informations : On this plateforme, we can determine the structure of RNA molecule, by footprint with RNases, or chemical modifications (SHAPE).

Used fluorophores :
oligo- FAM (540 nm)
oligo - VIC (560 nm)
oligo - NED (580 nm)
oligo - PET (610 nm)

Description of the SHAPE (= Selective 2’Hydroxyl Acylation Analysed by Primer Extension)

Example of structure determination by SHAPE

Contact : Anne-Catherine HELFER-LE FOLL